Las Eubacterias o Bacteria son organismos procariotas muy abundantes.

Se caracterizan por su simplicidad estructural . Suelen ser de pequeño tamaño (1 a 10µm), carecen de núcleo diferenciado, poseen un único cromosoma circular formado por ADN sin proteínas estructurales, generalmente carecen de membranas intracelulares y nunca tienen ni mitocondrias ni plastos.

Presentan pared celular, a veces muy compleja, pero que siempre lleva un polímero conocido como peptidoglucano o mureína.
Pueden llevan flagelos en diferente número y localización como medio de desplazamiento, pero su estructura y funcionamiento es muy diferente de sus análogos eucariotas.

Los diferentes tipos de bacterias tienen medios de nutrición muy variados

Existen formas heterótrofas que se nutren de una gran cantidad de fuentes orgánicas diferentes, pueden ser respiradoras o fermentadoras, aerobias o anaerobias. Algunas incluso obtienen energía de la luz pero toman materia orgánica para formar sus moléculas. Hay formas saprófitas, simbiontes con otros organismos, parásitos extra e intracelulares y existen algunas formas predadoras.
Entre las formas autótrofas, las hay que obtienen su energía de reacciones químicas (quimiolitotrofas), mientras que otras la obtienen de la luz (fotolitotrofas). Entre éstas últimas las hay que rinden oxígeno como producto desecho final del proceso, como algas y plantas (cianobacterias), mientras que otras producen otras sustancias oxidadas diferentes del oxígeno, como azufre o materia orgánica (bacterias fotosintéticas).

Se calcula que la masa de bacterias supera al menos en un orden de magnitud, y posiblemente en dos al resto de seres vivos.

Son organismos fundamentales desde el punto de vista ecológico, tanto por su elevada biomasa en casi todos lo ecosistemas acuáticos, como por su intervención en los ciclos biogeológicos, algunos de los cuales no se completarían sin su existencia. Tiene gran importancia ecológica, debido a la capacidad de algunos procariontes de fijar el nitrógeno atmosférico.

El origen de los orgánulos eucariontes conocidos como mitocondrias y cloroplastos es la simbiosis con bacterias respiradoras y fotosintéticas, respectivamente.

Morfológicamente presentan poca variedad, siendo las formas más habituales las alargadas (bacilos), o esféricas (cocos). No existen organismos pluricelulares y las formas multicelulares son escasas, asociándose las células en filamentos o en masas con alguna diferenciación celular pero sin el desarrollo de tejidos.

Dado su pequeño tamaño y la falta de estructuración pluricelular sólo son activos en medios acuáticos o muy húmedos, sin embargo son capaces de resistir condiciones extremas del medio y periodos de tiempo muy prolongados sin alimento merced a una forma de resistencia conocida como espora (que no tiene que ver con las esporas reproductoras del reino de las Metafitas). Se han encontrado bacterias viables sepultadas en sedimentos de varios millones de años de antigüedad.

La taxonomía de las bacterias es compleja y las relaciones entre los principales grupos han debido de revisarse recientemente.

Los grupos más destacados son:

• Proteobacterias
  Grupo muy amplio de bacterias entre las que se encuentran
  • Bacteris fotosintéticas purpúreas
  • Bacterias fijadoras de nitrógeno
  • Antepasados de las mitocondrias eucariotas
  • Bacterias entéricas y diversos parásitos digestivos de animales
  • Bacterias reductoras del azufre y del sulfato
  • Mixobacterias. Forman filamentos semejantes a hongos
• Espiroquetas - Bacterias en forma de espiral de movimientos rápidos
• Bacterias verdes del azufre - Fotosintetizan y producen azufre en lugar de oxígeno
• Bacterias gram positivas - Pared celular peculiar. Grupo muy amplio que incluye actinomicetos semejantes a hongos, fijadoras de nitrógeno, patógenos como la tuberculosis, lepra, carbunco, gangrena, tétanos, la lepra, bacterias del suelo formadoras de esporas (bacillus), bacterias fermentadoras..
• Cianobacterias - Fotosintéticas que producen oxígeno. Antepasados de los cloroplastos.

Las cianobacterias son productores importantes en los ecosistemas acuáticos, de las que se nutren otros organismos.
Del mismo modo, gran parte de la eliminación de materia orgánica en medios húmedos corre a cargo de bacterias fermentadoras y respiradoras.
Son importantes productores de nutrientes vegetales, interviniendo en los ciclos del nitrógeno, fijando nitrógeno atmosférico y produciendo nitratos, y en el del azufre, produciendo sulfatos asimilables por las plantas. En otras condiciones, en especial en medios anaerobios, secuestran estos nutrientes para su respiración. Las bacterias fermentadoras se utilizan en la conservación de alimentos como queso y yogourt .
Muchas enfermedades son causadas por bacterias, especialmente en animales. Entre las humanas se pueden citar las siguientes: neumonías, tuberculosis, meningitis, tosferina, faringitis, catarros bacterianos, gangrena, tétanos, sífilis, gonorrea, cólera, salmonerosis, peste, y muchas más.